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技術(shù)速遞丨使用Biozen色譜柱評估包括聚集和衣殼負載在內(nèi)的AAV關鍵質(zhì)量屬性

2024-11-26

概述

腺相關病毒載體(AAV)用于遞送治療性基因。它們由約 3.7 Mda 的蛋白質(zhì)衣殼組成,包含最多約 5 千堿基的基因組。我們對AAV的幾個關鍵質(zhì)量屬性(CQA)進行了評估,包括DNA和蛋白質(zhì)組分。聚集是需要控制的CQA之一,因為AAV容易聚集,并且受凍融的影響很大。此外,另一個重要因素是空殼比的存在,它們被認為是雜質(zhì),會對治療產(chǎn)品的療效和安全性產(chǎn)生不利影響。因此,準確評估完整/空殼比對保證產(chǎn)品質(zhì)量至關重要。


通常情況下,人們使用分析超速離心法來測定 AAV 的完整/空殼比。該技術(shù)具有可重現(xiàn)性,但需要大量樣品,且在GMP環(huán)境下實施具有挑戰(zhàn)性。另一種選擇是尺寸排除色譜法與多角度光散射(SEC-MALS)相結(jié)合。SEC-MALS 具有幾個優(yōu)點,包括無需樣品制備,從而顯著提高了通量。此外,基因組和衣殼的摩爾質(zhì)量信息,以及它們的顆粒濃度,都可以與完整/空殼比一起確定。在本應用中,我們強調(diào)了 Biozen dSEC-7 色譜柱除了能夠可靠地從兩種 AAV 血清型中分離單體和聚集體,還可以結(jié)合 SEC-MALS,準確測定樣品中的衣殼和 DNA 摩爾質(zhì)量、顆粒濃度以及完整 AAV 百分比。


色譜條件


色譜柱:Biozen 3 μm dSEC-7

規(guī)格:300 x 4.6 mm

貨號:00H-4789-E0

流動相:20 mM 磷酸鹽緩沖液 + 350 mM 氯化鉀 pH 6.6

流速:0.35 mL/min (Isocratic)

進樣量:25 μL

溫度:25 ℃

LC 系統(tǒng):Agilent? 1260 Infinity II Bio-Inert LC System

檢測器:MALS, RI, and UV @ 260 nm, 280 nm


AAV5 血清型的總摩爾質(zhì)量,以及結(jié)合蛋白質(zhì)和基因組在其中的占比,被確定為 4.69 MDa(圖 1)。在 260 和 280 nm 波長下,測定蛋白質(zhì)衣殼和 DNA 的消光系數(shù)。實驗測定值與理論值接近,表明 AAV5 樣品的組裝是正確的(表 1)。根據(jù)這些值,計算出 AAV5 血清型樣品的完整/空殼比為 0.94,表明分析樣品的衣殼填充率為 94%。與 AAV5 樣品中觀察到的現(xiàn)象類似,AAV8 樣品的聚集體和單體也能夠被很好的分離(圖 2)。經(jīng)過評估和測定后,總摩爾質(zhì)量以及結(jié)合蛋白質(zhì)和 DNA 摩爾質(zhì)量的占比,被確定為 4.53 MDa。測定了該樣品的兩個消光系數(shù),實驗值與理論值相當(表 2)。AAV8 樣品的完整/空殼比為 0.82,表明該樣品的衣殼填充率為 82%。


分析物

總分子量(MDa)

衣殼分子量 (MDa)

核酸分子量(MDa)

總(粒子/mL)

完整/空衣殼比

AAV5-Empty

3.85

3.85

-

1.82E+13

-

AAV5-CMV-GFP

4.69

3.75

0.95

1.38E+13

0.94

圖 1. AAV5 空衣殼(上)和完整衣殼(下)的摩爾質(zhì)量測定


表 1. AAV5 在 260 nm 和 280 nm 波長下的消光系數(shù)比較

波長

蛋白質(zhì)消光系數(shù)

DNA 消光系數(shù)

理論

實驗

理論

實驗

260 nm

1.30

1.26

24.00

23.51

280 nm

2.10

2.15

14.60

14.08


分析物

總分子量(MDa)

衣殼分子量(MDa)

核酸分子量(MDa)

總(粒子/mL)

完整/空衣殼比

AAV8-Empty

3.94

3.94

-

2.25E+13

-

AAV8-CMV-GFP

4.53

3.72

0.81

9.69E+13

0.82

圖 2. AAV8 空衣殼(上)和 AAV5 完整衣殼(下)的摩爾質(zhì)量測定


表 2. AAV8 在 260 nm 和 280 nm 波長下的消光系數(shù)比較

波長

蛋白質(zhì)消光系數(shù)

DNA 消光系數(shù)

理論

實驗

理論

實驗

260 nm

1.30

1.38

24.00

25.62

280 nm

2.10

2.14

14.60

14.51


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